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不同类型样本裂解方案综合指南|EnkiLife恩玑生命

发表时间:2026-06-22

       几乎所有对蛋白质功能、表达、定位、修饰和相互作用的研究,都始于一个关键步骤:将蛋白质从其复杂的细胞或组织环境中释放出来,即细胞裂解与蛋白质提取。一个成功的裂解方案必须实现两个看似矛盾的目标:其一,要足够“暴力”,能够彻底打破细胞膜、细胞壁(对于植物和某些微生物)以及组织基质的屏障;其二,又要足够“温和”,可以最大限度地保护目标蛋白质免于降解、变性、氧化或非特异性聚集,从而保持其天然的结构和生物活性。

       然而,生物样本的多样性为这一过程带来了巨大的挑战。坚韧的植物细胞壁、富含结缔组织的动物肌肉、充满高丰度干扰蛋白的血液样本,以及脆弱的培养细胞,其物理和化学性质迥异,决定了不存在一种“万能”的裂解方案。不恰当的方案可能导致蛋白质产量低下、特定类型的蛋白质(如膜蛋白、核蛋白)提取不完全、蛋白质被内源性蛋白酶降解,或产生与下游分析技术不兼容的裂解产物。

      细胞裂解和蛋白质提取是研究细胞蛋白质的关键步骤,为蛋白质印迹、酶活性测定和质谱分析等众多下游应用奠定了基础。

一、通用裂解基础原则

1. 全程低温:所有操作在冰上进行,裂解液预冷,防止蛋白降解。

2. 抑制剂及时添加:使用前新鲜加入蛋白酶抑制剂(PMSF、蛋白酶抑制剂 cocktail),研究磷酸化蛋白需加磷酸酶抑制剂(钒酸钠、氟化钠、β- 甘油磷酸钠)。

3. 机械破碎辅助:组织样本仅靠裂解液无法充分释放蛋白,需配合研磨、超声、匀浆仪等物理手段。

4. 裂解时间控制:冰上裂解 30~60 min,避免过长时间导致蛋白降解。

5. 离心澄清:裂解后 12000~14000 g,4℃离心 10~15 min,取上清即为总蛋白。

EnkiLife(恩玑生命)大分子蛋白专用细胞/组织裂解液(Cat#:RC0005):

? 完整抽提大分子蛋白质。

? 保护蛋白质翻译后修饰(如磷酸化、糖基化、泛素化、甲基化和乙酰化)。

? 一步到位,无需添加酶抑制剂。

? 兼容细胞与组织样本。

验证数据: 样本兼容性实验


图A:使用RC0005裂解 HeLa 细胞和小鼠大脑组织(各2组样本),用mTOR (289 kDa)抗体对裂解物进行免疫印迹,裂解物上样量为50μg。

图B:使用RC0005裂解 HeLa 细胞和小鼠大脑组织(各2组样本),用GAPDH(37kDa)抗体对裂解物进行免疫印迹,裂解物上样量为50μg。

数据显示RC0005对细胞样本和组织样本均有优秀的裂解效果,同时兼容不同大小的蛋白样本。

二、细胞样本裂解

细胞样本结构简单,无细胞外基质阻碍,裂解难度最低,分为贴壁细胞与悬浮细胞两类。

1.贴壁细胞样本(HeLa、293T、肿瘤细胞等)

样本处理

弃培养PBS洗涤2-3次

裂解液推荐

RIPA(强,完全裂解)NP-40(温和,保留复合物)

裂解方式

冰上孵育30 min

离心条件

12,000-14,000 rpm,4°C,15 min,收集上清

Tips

可直接在培养皿中裂解(加裂解液后刮取)

2. 悬浮细胞

样本处理

离心收集(500-1000 rpm,5 min);PBS洗涤1-2次

裂解液推荐

NP-40 或 RIPA

裂解方式

冰上孵育30 min,期间每 10 min 用移液器反复吹打数次,确保细胞完全裂解

离心条件

12,000,4°C,10-15 min

三、动物组织裂解

动物组织因细胞外基质丰富、组织致密程度差异极大,需根据组织特性选择破碎方式与裂解液强度。核心原则:越致密、纤维越多的组织,机械破碎强度越高;酶活性越高的组织,抑制剂越要足量

1. 脑组织

样本特点

脂质含量极高(髓鞘丰富),蛋白丰度中等,内源蛋白酶活性中等,质地偏软。

样本处理

新鲜取材后立即置于冰上;去除脑膜和血管;可分区(皮层、海马、小脑等)

裂解液推荐

1% SDS 的强 RIPA 裂解液(增强膜蛋白溶解)

机械破碎

组织匀浆器匀浆直至无明显肉眼可见固体

裂解方式

冰上孵育30分钟,间歇涡旋2-3 次

离心条件

12,000-14,000 rpm,4°C,15-20分钟取中间澄清层(避开上层脂质层和下层沉淀)

Tips

脑组织脂质多,离心后上层会有白色脂层,取样时务必避开,否则会影响后续 WB实验

2. 肝脏组织

样本特点

蛋白含量极高,内源蛋白酶、磷酸酶活性极强,质地松软易破碎。

样本处理

去除胆囊和结缔组织;PBS 冲洗去除血液,滤纸吸干

裂解液推荐

常规 RIPA + 双倍剂量蛋白酶 / 磷酸酶抑制剂

机械破碎

组织匀浆器匀浆直至无明显肉眼可见固体

裂解方式

冰上裂解 30 min,间歇涡旋2-3 次

离心条件

12,000-14,000 rpm,4°C,15分钟,取上清

Tips


  • 肝脏蛋白酶活性极强,PMSF 需临用前添加,且浓度提高至 2 mM。
  • 血液会干扰蛋白定量,务必用 PBS 充分灌流或冲洗干净。
  • 肝脏蛋白浓度高,后续定量时需加大稀释倍数。




3. 心脏/肌肉组织

样本特点

肌纤维丰富、组织致密,机械强度高,普通匀浆难以充分破碎;线粒体蛋白丰富

裂解液推荐

RIPA + 超声辅助破碎

机械破碎

液氮研磨最佳研磨至无颗粒感

裂解方式

冰上裂解 30 min,期间超声辅助破碎

离心条件

12,000-14,000 rpm,4°C,20分钟

Tips


  • 液氮研磨是肌肉组织最有效的破碎方式,研磨不充分会导致得率极低。
  • 超声避免产生泡沫,防止蛋白氧化变性。



4. 肾脏组织

样本特点

血管网络密集,血液残留量大;皮质(肾小球、肾小管为主)与髓质蛋白表达谱差异显著;组织质地偏韧,细胞外基质含量中等;内源蛋白酶、磷酸酶活性较强,且含大量膜转运蛋白、离子通道与受体蛋白。

样本处理

去除肾包膜;可分区(皮质/髓质)

裂解液推荐

RIPA 裂解液;研究膜转运蛋白可选用含 1% SDS 的增强型 RIPA

机械破碎

组织匀浆器匀浆直至无明显肉眼可见固体质地偏韧的样本也可先液氮研磨成细粉,再加入裂解液重悬。

裂解方式

冰上裂解 30 min,每 10 min 涡旋混匀一次

离心条件

12,000 rpm,4°C,15-20 min吸取中间澄清上清,弃去底层细胞碎片沉淀及表层少量脂膜。

Tips


  • 血液残留是肾脏样本最核心的干扰因素,会导致白蛋白、血红蛋白等血液蛋白占比过高,掩盖内源组织蛋白条带,务必通过在体灌流或离体反复漂洗充分去除血液
  • 肾脏皮质与髓质功能、蛋白谱差异极大,实验设计需明确取材部位;常规总蛋白提取优先选取肾皮质,目标蛋白丰度更高、结果更稳定。
  • 肾脏内源磷酸酶活性较高,研究磷酸化修饰蛋白时,需新鲜配制并加入足量磷酸酶抑制剂,全程严格低温操作,避免磷酸化信号衰减。




5. 脂肪组织

样本特点

脂质占比极高,蛋白含量极低,常规方法得率差

样本处理

去除血管和结缔组织;尽量去除多余脂肪PBS 冲洗,剪碎

裂解液推荐

1-2% SDS的裂解液(脂质需高浓度去污剂)

机械破碎

组织匀浆器匀浆直至无明显肉眼可见固体

裂解方式

冰上裂解 30 min

离心条件

12,000 rpm,4°C,20 min,小心吸取下层水相蛋白溶液,完全弃去上层油脂必要时用氯仿 - 甲醇法沉淀蛋白,去除残留脂质

Tips


  • 肪组织蛋白得率低,需加大初始样本量。
  • 离心后脂层与水相分界明显,取样时枪头穿过脂层时避免带入油脂。
  • 油脂残留会导致 SDS-PAGE 电泳条带弥散、泳道拖尾。




6. 脾脏

样本特点

血窦系统高度发达,血液残留量极大,红细胞占比高;组织质地松软,内源蛋白酶与核酸酶活性较强,易出现蛋白降解,血液蛋白易掩盖内源组织蛋白信号。

样本处理

脾脏用预冷 PBS 反复冲洗表面,轻柔挤压排出血窦内残血,有条件优先采用心脏灌注取材以彻底去除血液

裂解液推荐

RIPA 裂解液

机械破碎

组织匀浆器匀浆直至无明显肉眼可见固体

裂解方式

冰上静置裂解 30 min

离心条件

12,000 rpm,4°C,15-20 min吸取中间澄清蛋白上清,避开底层细胞碎片与红细胞沉淀

Tips


  • 严控血液污染灌注取材是最优解决方案若离心后上清仍偏红,可再次低速离心去除残留红细胞。
  • 防范蛋白降解免疫细胞内源蛋白酶活性高,取材后禁止室温放置,需立即液氮速冻或全程冰上操作。



7. 肠道组织

样本特点

(1)结构分层明显,蛋白谱差异大

(2)腔内杂质多,污染风险高

(3)蛋白降解风险极高

样本处理

按实验需求截取对应肠段(十二指肠 / 空肠 / 回肠 / 结肠),纵向剪开,去除内容物;PBS轻柔冲洗;可分离黏膜/肌层

裂解液推荐

RIPA裂解液

机械破碎

(1)黏膜层样本组织匀浆器匀浆直至无明显肉眼可见固体

(2)全层 / 肌层样本液氮中研磨成均匀细粉再加入裂解液重悬

裂解条件

冰上静置裂解 30 min,每 10 min 轻涡旋混匀一次

离心条件

12,000 rpm,4°C,15分钟若上清仍浑浊黏稠,可重复离心一次,或经短暂超声后再次离心

Tips


  • 黏液干扰,需充分冲洗
  • 蛋白酶活性高肠道蛋白酶种类多、活性强,必须搭配广谱蛋白酶抑制剂 cocktail,PMSF 终浓度可提高至 2 mM。



8. 血液

样本类型

特点

处理方式

全血

含红细胞、白细胞、血小板及血浆蛋白


  •     100-200 μL 全血,加入 2-3 倍体积 红细胞裂解液(如 ACK 裂解液),室温静置 5-10 min,裂解红细胞
  •     4°C,300×g 离心 5 min,弃上清,保留白细胞沉淀
  •     用预冷 PBS 洗涤白细胞沉淀 2 次
  •     加入 RIPA 裂解液(含 1% 蛋白酶抑制剂),按 10? 细胞/100-200 μL 比例
  •     冰上裂解 30 min,期间每 10 min 涡旋振荡 1 次
  •     4°C,12,000×g 离心 15-20 min,取上清即为蛋白提取液


血清

去除血细胞和纤维蛋白原后的上清

新鲜全血室温静置 30~60 min 待充分凝血,3000 g、4℃离心 15 min,小心吸取上层淡黄色澄清血清,避免触碰中间白细胞层与底层红细胞。直接稀释使用,无需裂解

血浆

含抗凝剂,保留纤维蛋白原

EDTA 抗凝全血颠倒混匀后,3000 g、4℃离心 15 min,取上层血浆。直接稀释使用,无需裂解

血细胞(PBMC/白细胞)

需裂解红细胞后分离    

1. PBMC 分离(密度梯度离心法) 


  •     新鲜 EDTA 抗凝血与等体积 PBS 稀释混匀,沿管壁缓慢叠加到 Ficoll-Paque 分离液液面上方,保持界面清晰。
  •     2000 g、室温离心 20 min(升降速调至最低,避免打破界面)。
  •     小心吸取中间乳白色的 PBMC 白膜层,转移至新离心管,加入 5~10 倍体积预冷 PBS 重悬洗涤。
  •     1500 g4℃离心 10 min,弃上清;重复洗涤 1~2 次,彻底去除残留血小板与分离液。


2. 细胞裂解 按每 1×10?细胞加入 100~200 μL 预冷裂解液,吹打重悬均匀,冰上裂解 30 min,每 10 min 轻涡旋一次。

3. 离心取上清 14000 g4℃离心 15 min,吸取中间澄清蛋白上清,弃底层细胞碎片沉淀。







四、植物组织裂解

植物样本有坚韧的细胞壁,且富含多酚、多糖、次生代谢物,易导致蛋白氧化褐变、沉淀,是裂解难度最高的样本类型。核心策略:液氮研磨破壁 + 多酚 / 多糖去除手段。且植物样本极易氧化,建议裂解后1个月内使用完,未裂解的样本,建议液氮保存长期保存,其次才考虑-80℃保存,注意-20℃保存不要超过1个月。

液氮研磨标准流程

步骤

操作

关键要点

研钵预冷

液氮预冷研钵

严禁干磨,液氮不足及时补充

取样

-80℃或液氮保存组织

立即用液氮冷冻

研磨

液氮研磨成细粉

保持低温,防止组织复冻

收集

液氮蒸发后用预冷药匙转移粉末

粉末装入含β-巯基乙醇的离心管

裂解

加入99:1裂解液 + 超声破碎

无需额外匀浆步骤

静置

4℃静置20-30分钟

使蛋白充分释放

离心

12,000-14,000 rpm离心15-20分钟取上清

底部白色沉淀可冷冻保存备用

1. 叶片组织

样本特点

细胞壁较薄,易研磨;叶绿体丰富,Rubisco(核酮糖二磷酸羧化酶)占比极高,易掩盖低丰度蛋白;多酚含量中等。

样本处理

液氮速冻;研磨成细粉

裂解液推荐

植物 RIPA + 1% PVP + 10 mM β- 巯基乙醇

机械破碎

液氮研磨首选

离心条件

12,000-14,000 rpm,4°C,15-20分钟,取上清;若上清仍有色素,可重复离心一次

Tips


  • 去除高丰度 Rubisco 可使用专门的植物蛋白富集试剂盒,提升低丰度蛋白检测灵敏度。
  • 幼嫩叶片比老叶更容易提取,蛋白完整性更好。
  • 叶绿素等色素会干扰 BCA 定量,建议用 Bradford 法或 2-D 定量试剂盒。




2.根组织

样本特点

纤维丰富,杂质多,多糖和次生代谢物含量高,易褐变;根表土壤易污染样本。

样本处理

清洗去除土壤;液氮速冻研磨成细粉

裂解液推荐

2% PVP、5% 甘油的裂解液,配合 TCA - 丙酮沉淀纯化

机械破碎

液氮研磨

离心条件

12,000 rpm,4°C,15分钟

Tips


  • 根系样本杂质多,直接裂解的样品杂质含量高,严重影响电泳质量,建议 TCA - 丙酮沉淀纯化。
  • 幼根比老根蛋白含量高、木质化程度低,优先选取根尖部位。



3.茎/枝干组织

样本特点

木质化程度高,纤维多,细胞壁厚且坚硬,研磨难度大;蛋白含量低于叶片

样本处理

去除表皮;剪取幼嫩部分剪成小块;液氮速冻

裂解液推荐

强裂解配方(含 2% SDS)

机械破碎

液氮研磨(木质化组织必需)

离心条件

14,000 rpm,4°C,20分钟

Tips


  • 木质化茎秆务必充分研磨,肉眼看不到纤维颗粒才算合格。
  • 加热辅助裂解可显著提高蛋白得率,但不适用于需要保持蛋白天然活性的实验。


4. 花

样本特点

木质化程度高,纤维多,细胞壁厚且坚硬,研磨难度大;蛋白含量低于叶片

样本处理

去除表皮;剪取幼嫩部分剪成小块;液氮速冻

裂解液推荐

强裂解配方(含 2% SDS)

机械破碎

液氮研磨(木质化组织必需)

离心条件

14,000 rpm,4°C,20分钟

Tips


  • 木质化茎秆务必充分研磨,肉眼看不到纤维颗粒才算合格。
  • 加热辅助裂解可显著提高蛋白得率,但不适用于需要保持蛋白天然活性的实验。








5. 种子

样本特点

坚硬种皮破壁、高含量储存杂质去除,以及内源酶活化导致的蛋白降解

样本处理

根据实验需求去除种皮,分离胚、胚乳等目标部位;蒸馏水快速冲洗表面灰尘,滤纸吸干水分。干燥种子直接液氮研磨,严禁浸泡水化,防止内源酶活化降解蛋白。

裂解液推荐

1. 淀粉 / 蛋白类种子:含 2% SDS 的强裂解液或植物强 RIPA 裂解液;高纯度需求搭配 TCA - 丙酮沉淀纯化。

2. 油料种子:强 RIPA 裂解液,必须搭配正己烷 / 石油醚脱脂预处理

机械破碎

液氮研磨

蛋白裂解方法一

淀粉 / 蛋白类种子(水稻、小麦、豆类等)


  • 1:10(质量:体积)加入预冷裂解液,快速涡旋混匀,冰上裂解 30 min,每 10 min 涡旋一次。
  • 14000 g4℃离心 20 min,吸取中间澄清上清;若下层淀粉沉淀厚重,可重复离心一次去除残留淀粉颗粒。
  • 高纯度实验需求:研磨后直接用 10% TCA - 丙酮溶液沉淀蛋白,步骤同花组织沉淀法,可彻底去除淀粉、多糖与多酚杂质。


蛋白裂解方法

油料种子(花生、油菜籽、芝麻等)


  • 研磨粉末加入预冷正己烷(或石油醚),涡旋混匀后静置 10 min12000 g 离心 5 min 弃上清;重复脱脂 2~3 次。
  • 通风处风干至无有机溶剂残留(约 5 min),避免有机溶剂导致蛋白变性。
  • 加入预冷强 RIPA 裂解液,涡旋混匀,冰上裂解 30 min
  • 14000 g4℃离心 20 min,小心吸取下层水相蛋白溶液,彻底避开表层残留油脂





五、RIPA裂解专属关键注意事项(避坑重点)

1. 抑制剂必须现加:PMSF在水溶液中极易降解,必须临用前加入RIPA,不可提前配制储存。

3. 低温操作:全程冰上/4℃操作,RIPA裂解过程产热会导致蛋白降解、磷酸化位点丢失。

4. 样本比例勿过量:组织/细胞过多、裂解液不足,会导致裂解不完全、蛋白浓度偏低、杂质过多。

5. 上清取用规范:离心后仅取清亮上清,坚决避免吸取油脂、沉淀,防止后续WB条带杂带、背景脏。

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